Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FXNQ16595 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FXNQ16595 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FXNQ16595 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FXNQ16595 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FXNQ16595 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FXNQ16595 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FXNQ16595 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FXNQ16595 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FXNQ16595 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
FXNQ16595 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
FXNQ16595 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FXNQ16595 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FXNQ16595 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FXNQ16595 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FXNQ16595 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FXNQ16595 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FXNQ16595 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FXNQ16595 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FXNQ16595 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FXNQ16595 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FXNQ16595 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FXNQ16595 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FXNQ16595 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FXNQ16595 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FXNQ16595 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FXNQ16595 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
FXNQ16595 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
FXNQ16595 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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FXNQ16595 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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FXNQ16595 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FXNQ16595 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FXNQ16595 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FXNQ16595 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FXNQ16595 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FXNQ16595 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FXNQ16595 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
FXNQ16595 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FXNQ16595 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FXNQ16595 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FXNQ16595 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FXNQ16595 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FXNQ16595 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FXNQ16595 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FXNQ16595 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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