Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
E2F4Q16254 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
E2F4Q16254 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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