Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC6Q16204 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC6Q16204 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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