Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
VPS72Q15906 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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VPS72Q15906 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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VPS72Q15906 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VPS72Q15906 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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