Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ODF1Q14990 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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ODF1Q14990 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ODF1Q14990 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
ODF1Q14990 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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