Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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