Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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