Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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PKP1Q13835 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PKP1Q13835 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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