Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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TUBA3CQ13748 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBA3CQ13748 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBA3CQ13748 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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