Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SEMA3FQ13275 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3FQ13275 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.6 ms