Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIK2Q13002 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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