Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CHD3Q12873 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CHD3Q12873 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
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