Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.52□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BPTFQ12830 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC-1.53□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BPTFQ12830 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
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