Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.25
GTF3C1Q12789 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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GTF3C1Q12789 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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GTF3C1Q12789 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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GTF3C1Q12789 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GTF3C1Q12789 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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