Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PGGT1BP53609 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PGGT1BP53609 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms