Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX29Q8TEQ0 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SNX29Q8TEQ0 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms