Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNF548Q8NEK5 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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ZNF548Q8NEK5 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ZNF548Q8NEK5 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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