Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
HIF1AQ16665 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HIF1AQ16665 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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