Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
NTRK3Q16288 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NTRK3Q16288 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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