Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TAF1AQ15573 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TAF1AQ15573 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 442.3 ms