Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
LAPTM4AQ15012 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LAPTM4AQ15012 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
LAPTM4AQ15012 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LAPTM4AQ15012 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LAPTM4AQ15012 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LAPTM4AQ15012 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LAPTM4AQ15012 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LAPTM4AQ15012 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LAPTM4AQ15012 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LAPTM4AQ15012 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
LAPTM4AQ15012 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
LAPTM4AQ15012 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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