Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
NR1I3Q14994 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NR1I3Q14994 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NR1I3Q14994 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NR1I3Q14994 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
NR1I3Q14994 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NR1I3Q14994 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NR1I3Q14994 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NR1I3Q14994 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NR1I3Q14994 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NR1I3Q14994 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NR1I3Q14994 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NR1I3Q14994 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NR1I3Q14994 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NR1I3Q14994 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NR1I3Q14994 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NR1I3Q14994 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NR1I3Q14994 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1I3Q14994 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1I3Q14994 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1I3Q14994 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1I3Q14994 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NR1I3Q14994 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NR1I3Q14994 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1I3Q14994 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1I3Q14994 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1I3Q14994 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1I3Q14994 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1I3Q14994 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1I3Q14994 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1I3Q14994 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1I3Q14994 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1I3Q14994 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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NR1I3Q14994 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1I3Q14994 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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