Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SCN5AQ14524 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SCN5AQ14524 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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