Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPSQ13938 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPSQ13938 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPSQ13938 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPSQ13938 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPSQ13938 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPSQ13938 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPSQ13938 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CAPSQ13938 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CAPSQ13938 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPSQ13938 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPSQ13938 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPSQ13938 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPSQ13938 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPSQ13938 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPSQ13938 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPSQ13938 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPSQ13938 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPSQ13938 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPSQ13938 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms