Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TUBB3Q13509 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TUBB3Q13509 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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