Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTK7Q13308 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTK7Q13308 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms