Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ATG3Q9NT62 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ATG3Q9NT62 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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