Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBP3Q9NS15 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
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LTBP3Q9NS15 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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LTBP3Q9NS15 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBP3Q9NS15 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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