Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHCHD4Q8N4Q1 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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