Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
USP53Q70EK8 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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USP53Q70EK8 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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USP53Q70EK8 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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USP53Q70EK8 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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USP53Q70EK8 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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USP53Q70EK8 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
USP53Q70EK8 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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