Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPN21Q16825 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPN21Q16825 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPN21Q16825 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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