Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
LAMA3Q16787 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
LAMA3Q16787 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.7 ms