Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF239Q16600 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ZNF239Q16600 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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