Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
E2F4Q16254 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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E2F4Q16254 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
E2F4Q16254 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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