Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NEDD8Q15843 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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