Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SKIV2LQ15477 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SKIV2LQ15477 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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