Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COL9A3Q14050 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
COL9A3Q14050 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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