| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.328-201 | ENST00000365208 | 113 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.366-201 | ENST00000365540 | 102 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-756P-201 | ENST00000383997 | 107 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR767-201 | ENST00000390228 | 109 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORA26-201 | ENST00000391286 | 122 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC008134.1-201 | ENST00000420943 | 193 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MRPS17P9-201 | ENST00000511924 | 393 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | IGHVIII-67-2-201 | ENST00000519849 | 88 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | ZNF415-224 | ENST00000601493 | 2132 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AP001318.4-201 | ENST00000616637 | 121 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL596211.1-201 | ENST00000569873 | 2277 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | CCPG1-203 | ENST00000442196 | 3453 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.163-201 | ENST00000363702 | 113 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORD61-201 | ENST00000384252 | 73 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORA12.1-201 | ENST00000390873 | 148 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORD72-201 | ENST00000390994 | 80 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SUMO1P4-201 | ENST00000429430 | 302 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MTATP6P21-201 | ENST00000440681 | 189 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC104389.3-201 | ENST00000445629 | 235 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-412P-201 | ENST00000516434 | 106 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-1149P-201 | ENST00000516810 | 97 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | CPSF6-207 | ENST00000551516 | 234 nt | TSL 2 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | JPX_2.1-201 | ENST00000614161 | 69 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | EYS-202 | ENST00000342421 | 2168 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU4-82P-201 | ENST00000362443 | 140 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-766P-201 | ENST00000362478 | 107 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-438P-201 | ENST00000365561 | 103 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORA51.5-201 | ENST00000384126 | 131 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNY4P29-201 | ENST00000410801 | 97 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.621-201 | ENST00000411065 | 96 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL513328.1-201 | ENST00000446460 | 224 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | HMGN2P18-201 | ENST00000450680 | 270 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-1096P-201 | ENST00000517089 | 102 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR376A2-201 | ENST00000636782 | 80 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MS4A14-202 | ENST00000395001 | 3401 nt | TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | CEP44-203 | ENST00000426172 | 3037 nt | TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-743P-201 | ENST00000364151 | 106 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC018634.1-201 | ENST00000437554 | 401 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RN7SL636P-201 | ENST00000497504 | 294 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORA31.1-201 | ENST00000515993 | 133 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORA31.5-201 | ENST00000516190 | 133 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR4662B-201 | ENST00000579498 | 81 nt | BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | PARPBP-203 | ENST00000392911 | 1916 nt | TSL 5 BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | NEDD4-205 | ENST00000506154 | 6751 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.48 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORA63.5-201 | ENST00000363548 | 123 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.500-201 | ENST00000384466 | 111 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORA67.4-201 | ENST00000384688 | 142 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR570-201 | ENST00000384917 | 97 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC008892.1-201 | ENST00000511861 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNA5SP112-201 | ENST00000515937 | 99 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.666-201 | ENST00000516187 | 112 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-504P-201 | ENST00000516568 | 104 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-586P-201 | ENST00000517265 | 104 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | 5S_rRNA.11-201 | ENST00000618635 | 84 nt | BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | ARHGAP28-204 | ENST00000419673 | 5492 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.47 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | WDFY3-AS2-202 | ENST00000451762 | 5814 nt | TSL 3 BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | PLOD2-204 | ENST00000461497 | 3043 nt | TSL 2 BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR488-201 | ENST00000365739 | 83 nt | BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC234781.5-201 | ENST00000508429 | 271 nt | BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SCARNA15-202 | ENST00000516881 | 127 nt | BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | IGLV3-17-201 | ENST00000519099 | 244 nt | BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC073413.2-201 | ENST00000604332 | 360 nt | BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL137067.1-201 | ENST00000615933 | 120 nt | BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AP000553.5-201 | ENST00000641933 | 54 nt | BASIC | 3.46 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | ZNF117-204 | ENST00000620222 | 5317 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR548A2-201 | ENST00000384956 | 97 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORA26.2-201 | ENST00000390922 | 122 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORD77.3-201 | ENST00000391113 | 65 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC007064.1-201 | ENST00000412238 | 351 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RPL39P34-201 | ENST00000477141 | 156 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC079804.2-201 | ENST00000490376 | 200 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNA5SP490-201 | ENST00000517141 | 136 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL357054.2-201 | ENST00000607644 | 423 nt | TSL 5 BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-1014P-201 | ENST00000383940 | 103 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-1328P-201 | ENST00000410938 | 106 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | LINC02532-205 | ENST00000430094 | 628 nt | TSL 5 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC233266.1-201 | ENST00000454518 | 96 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RPS29P21-201 | ENST00000496272 | 170 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC011406.1-201 | ENST00000512440 | 370 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-109P-201 | ENST00000516364 | 107 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-184P-201 | ENST00000516514 | 107 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-1291P-201 | ENST00000516591 | 104 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC121758.2-201 | ENST00000553271 | 193 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC242852.1-201 | ENST00000612151 | 96 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC244015.1-201 | ENST00000622301 | 99 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR1291-201 | ENST00000627649 | 87 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | CTSLP2-204 | ENST00000629029 | 392 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AKAP7-209 | ENST00000541650 | 2008 nt | TSL 5 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | UHMK1-204 | ENST00000545294 | 8117 nt | TSL 2 BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.253-201 | ENST00000364562 | 112 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL117342.1-201 | ENST00000404861 | 406 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR1302-5-201 | ENST00000408164 | 150 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-1186P-201 | ENST00000410429 | 97 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RPL23AP94-201 | ENST00000512518 | 302 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-240P-201 | ENST00000516098 | 97 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC103810.6-201 | ENST00000606708 | 136 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC091564.4-201 | ENST00000533934 | 2194 nt | BASIC | 3.43 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC009487.4-201 | ENST00000624969 | 3585 nt | BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | CEP57L1-213 | ENST00000520883 | 2055 nt | TSL 5 BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-486P-201 | ENST00000363116 | 107 nt | BASIC | 3.42 | □□□□□ -1.86 | | |