Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPM6BQ13491 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPM6BQ13491 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPM6BQ13491 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
GPM6BQ13491 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPM6BQ13491 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPM6BQ13491 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPM6BQ13491 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
GPM6BQ13491 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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GPM6BQ13491 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GPM6BQ13491 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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GPM6BQ13491 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
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GPM6BQ13491 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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GPM6BQ13491 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GPM6BQ13491 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
GPM6BQ13491 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GPM6BQ13491 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GPM6BQ13491 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GPM6BQ13491 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
GPM6BQ13491 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPM6BQ13491 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPM6BQ13491 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPM6BQ13491 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPM6BQ13491 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPM6BQ13491 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GPM6BQ13491 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPM6BQ13491 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPM6BQ13491 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPM6BQ13491 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GPM6BQ13491 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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