Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
MRPL49Q13405 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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