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| PTK7 | Q13308 | RNU6-153P-201 | ENST00000364422 | 104 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.336-201 | ENST00000365307 | 109 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.410-201 | ENST00000383992 | 113 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR548A2-201 | ENST00000384956 | 97 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
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| PTK7 | Q13308 | FO680682.1-201 | ENST00000421261 | 345 nt | TSL 3 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
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| PTK7 | Q13308 | ARHGAP28-204 | ENST00000419673 | 5492 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | VSTM2A-OT1-201 | ENST00000456049 | 3031 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC007598.1-202 | ENST00000561528 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC108081.1-201 | ENST00000604358 | 221 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | SLC30A6-202 | ENST00000357055 | 4758 nt | TSL 2 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | OGN-202 | ENST00000375561 | 2743 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC008264.2-201 | ENST00000610193 | 3731 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | PIK3C2G-201 | ENST00000266497 | 4764 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | GPR22-201 | ENST00000304402 | 2942 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | GYPA-201 | ENST00000324022 | 751 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNY4P18-201 | ENST00000391107 | 89 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC007064.1-201 | ENST00000412238 | 351 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC087499.2-201 | ENST00000432861 | 149 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC108938.1-201 | ENST00000451204 | 136 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
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| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.651-201 | ENST00000459380 | 103 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | PDCD5P2-201 | ENST00000507570 | 312 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP236-201 | ENST00000516169 | 116 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC025166.1-201 | ENST00000612411 | 163 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | Clostridiales-1.3-201 | ENST00000637703 | 147 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | RGPD3-202 | ENST00000409886 | 5594 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | DMD-203 | ENST00000357033 | 13956 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | OR4C11-202 | ENST00000641580 | 2737 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL391516.1-201 | ENST00000554380 | 2449 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC093831.2-201 | ENST00000624393 | 3427 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZNF117-204 | ENST00000620222 | 5317 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZNF680-202 | ENST00000447137 | 2159 nt | TSL 2 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORA80E-201 | ENST00000384744 | 137 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP109-201 | ENST00000391010 | 116 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.630-201 | ENST00000411370 | 108 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL157709.1-201 | ENST00000412695 | 424 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | RN7SL499P-201 | ENST00000481141 | 276 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
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| PTK7 | Q13308 | MIR5197-201 | ENST00000583721 | 112 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR133A1HG-202 | ENST00000581072 | 4226 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL161431.1-201 | ENST00000618966 | 4205 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| PTK7 | Q13308 | MUC15-202 | ENST00000436318 | 3118 nt | TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD115-28-201 | ENST00000363931 | 81 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-1189P-201 | ENST00000383958 | 107 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-950P-201 | ENST00000384651 | 107 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-440P-201 | ENST00000390882 | 105 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6ATAC40P-201 | ENST00000408580 | 137 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL354733.1-201 | ENST00000458016 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-781P-201 | ENST00000516377 | 101 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP137-201 | ENST00000516833 | 135 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC022202.1-201 | ENST00000613515 | 211 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | VPS54-202 | ENST00000354504 | 3594 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | MCF2-208 | ENST00000519895 | 3346 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | GABRG2-215 | ENST00000639213 | 9960 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | TDRD15-201 | ENST00000405799 | 6135 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZNF567-201 | ENST00000360729 | 2691 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | ANKRD18EP-201 | ENST00000405487 | 2632 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-268P-201 | ENST00000364174 | 107 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU1-148P-201 | ENST00000384472 | 162 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD116-21-201 | ENST00000384507 | 92 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | HMGN2P35-201 | ENST00000412164 | 270 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | BX510359.4-201 | ENST00000423750 | 193 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL606517.2-201 | ENST00000442855 | 241 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | STAG3L5P-204 | ENST00000443759 | 179 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC079760.1-201 | ENST00000456952 | 202 nt | TSL 3 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC131956.1-201 | ENST00000506420 | 258 nt | TSL 2 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-589P-201 | ENST00000516485 | 107 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU7-70P-201 | ENST00000516941 | 66 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC084364.2-201 | ENST00000546924 | 395 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC135178.3-204 | ENST00000585181 | 451 nt | TSL 2 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | MALAT1-207 | ENST00000613376 | 132 nt | TSL 3 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR8054-201 | ENST00000620877 | 86 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | AF165147.1-201 | ENST00000433310 | 6103 nt | TSL 2 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZNF415-224 | ENST00000601493 | 2132 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU1-109P-201 | ENST00000383960 | 147 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU11-3P-201 | ENST00000391111 | 133 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP274-201 | ENST00000410484 | 108 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |