Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM28Q13263 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM28Q13263 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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