Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
SRSF5Q13243 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SRSF5Q13243 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SRSF5Q13243 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SRSF5Q13243 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SRSF5Q13243 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms