Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TRAF3Q13114 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.9 ms