Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRAF1Q13077 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRAF1Q13077 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms