Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BNIP3Q12983 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BNIP3Q12983 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BNIP3Q12983 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BNIP3Q12983 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
BNIP3Q12983 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171 ms