Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPREP23469 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPREP23469 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPREP23469 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPREP23469 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPREP23469 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPREP23469 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PTPREP23469 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPREP23469 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PTPREP23469 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPREP23469 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPREP23469 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPREP23469 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPREP23469 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPREP23469 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPREP23469 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPREP23469 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPREP23469 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPREP23469 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPREP23469 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PTPREP23469 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPREP23469 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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PTPREP23469 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPREP23469 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPREP23469 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPREP23469 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPREP23469 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPREP23469 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPREP23469 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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PTPREP23469 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPREP23469 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPREP23469 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPREP23469 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPREP23469 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPREP23469 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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PTPREP23469 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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PTPREP23469 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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PTPREP23469 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPREP23469 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPREP23469 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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PTPREP23469 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPREP23469 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPREP23469 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPREP23469 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPREP23469 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPREP23469 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPREP23469 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPREP23469 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPREP23469 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPREP23469 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PTPREP23469 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPREP23469 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPREP23469 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPREP23469 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPREP23469 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPREP23469 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPREP23469 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPREP23469 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPREP23469 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPREP23469 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPREP23469 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPREP23469 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPREP23469 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPREP23469 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPREP23469 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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