Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRDP23468 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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