Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MEIS1O00470 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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