Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC-2.46□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-2.46□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC-2.47□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC-2.47□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC-2.47□□□□□ -2.8
XIRP2A4UGR9 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-2.47□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-2.47□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-2.48□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-2.49□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC-2.49□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.52□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-2.52□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
XIRP2A4UGR9 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms